Standalone program to label structures on a local machine: https://github.com/vivekmodi/Kincore-standalone.

Fasta file with conformational annotations and sequences for all protein kinase structures in PDB: PK_labels_PDB.fasta.

Download structure files renumbered by:
All.zip

Grouped by: Conformation label
Spatial Label Dihedral Label
DFGin_All BLAminus
BLAplus
ABAminus
BLBminus
BLBplus
BLBtrans
DFGin-Noise
DFGinter_All BABtrans
DFGinter-Noise
DFGout_All BBAminus
DFGout-Noise
Kinase group and gene
Group Gene
AGC_All AKT1  AKT2  CDC42BPB  DMPK  GRK2  GRK4  GRK5  GRK6  MASTL  PDPK1  PKN1  PKN2  PRKACA  PRKCA  PRKCB  PRKCH  PRKCI  PRKCQ  PRKG1  ROCK1  ROCK2  RPS6KA1_1  RPS6KA3_1  RPS6KA5_1  RPS6KA6_1  RPS6KB1  SGK1  STK32A  STK38 
CAMK_All AURKA  AURKB  AURKC  CAMK1  CAMK1D  CAMK1G  CAMK2A  CAMK2B  CAMK2D  CAMK2G  CAMK4  CAMKK1  CAMKK2  CASK  CHEK1  CHEK2  DAPK1  DAPK2  DAPK3  DCLK1  MAPKAPK2  MAPKAPK3  MARK1  MARK2  MARK3  MARK4  MELK  MKNK1  MKNK2  MYLK4  PASK  PHKG2  PIM1  PIM2  PLK1  PLK2  PLK3  PLK4  PRKAA1  PRKAA2  RPS6KA1_2  RPS6KA3_2  RPS6KA5_2  SNRK  STK11  STK17A  STK17B  STK40  TRIB1  TRIB2  TTN 
CK1_All CSNK1A1  CSNK1D  CSNK1E  CSNK1G1  CSNK1G2  CSNK1G3  TTBK1  TTBK2  VRK1  VRK2 
CMGC_All CDK1  CDK11B  CDK12  CDK13  CDK16  CDK2  CDK4  CDK5  CDK6  CDK7  CDK8  CDK9  CDKL1  CDKL2  CDKL3  CDKL5  CLK1  CLK2  CLK3  CLK4  CSNK2A1  CSNK2A2  DYRK1A  DYRK2  DYRK3  GSK3B  HIPK2  HIPK3  MAPK1  MAPK10  MAPK11  MAPK12  MAPK13  MAPK14  MAPK3  MAPK6  MAPK7  MAPK8  MAPK9  PRPF4B  SRPK1  SRPK2 
NEK_All NEK1  NEK2  NEK7 
STE_All MAP2K1  MAP2K2  MAP2K4  MAP2K6  MAP2K7  MAP3K14  MAP3K5  MAP3K8  MAP4K1  MAP4K3  MAP4K4  OXSR1  PAK1  PAK3  PAK4  PAK5  PAK6  SLK  STK10  STK24  STK25  STK26  STK3  STK4  STRADA  TAOK3  TNIK 
TKL_All ACVR1  ACVR2A  ACVR2B  ACVRL1  BMPR1B  BMPR2  BRAF  ILK  IRAK1  IRAK3  IRAK4  KSR1  KSR2  LIMK1  LIMK2  LRRK2  MAP3K12  MAP3K20  MAP3K21  MAP3K7  MAP3K9  RAF1  RIPK1  RIPK2  RIPK3  TGFBR1  TGFBR2  TNNI3K 
TYR_All ABL1  ABL2  ALK  AXL  BMX  BTK  CSF1R  CSK  DDR1  DDR2  EGFR  EPHA2  EPHA3  EPHA5  EPHA7  EPHA8  EPHB1  EPHB2  EPHB3  EPHB4  ERBB2  ERBB3  ERBB4  FES  FGFR1  FGFR2  FGFR3  FGFR4  FLT1  FLT3  FYN  HCK  IGF1R  INSR  ITK  JAK1_1  JAK1_2  JAK2_1  JAK2_2  JAK3_2  KDR  KIT  LCK  LMTK3  LYN  MERTK  MET  MST1R  NTRK1  NTRK2  NTRK3  PDGFRA  PTK2  PTK2B  PTK6  PTK7  RET  ROR1  ROR2  ROS1  RYK  SRC  SYK  TEK  TNK2  TYK2_1  TYK2_2  ZAP70 
OTHER_All AAK1  BMP2K  CDC7  CHUK  EIF2AK2  EIF2AK3  EIF2AK4_2  ERN1  GAK  IKBKB  MLKL  PBK  PKMYT1  RNASEL  STK16  TBK1  TLK2  TTK  ULK1  ULK2  ULK3  ULK4  WEE1  WEE2  WNK1  WNK3 
All.zip

Grouped by: Conformation label
Spatial Label Dihedral Label
DFGin_All BLAminus
BLAplus
ABAminus
BLBminus
BLBplus
BLBtrans
DFGin-Noise
DFGinter_All BABtrans
DFGinter-Noise
DFGout_All BBAminus
DFGout-Noise
Kinase group and gene
Group Gene
AGC_All AKT1  AKT2  CDC42BPB  DMPK  GRK2  GRK4  GRK5  GRK6  MASTL  PDPK1  PKN1  PKN2  PRKACA  PRKCA  PRKCB  PRKCH  PRKCI  PRKCQ  PRKG1  ROCK1  ROCK2  RPS6KA1_1  RPS6KA3_1  RPS6KA5_1  RPS6KA6_1  RPS6KB1  SGK1  STK32A  STK38 
CAMK_All AURKA  AURKB  AURKC  CAMK1  CAMK1D  CAMK1G  CAMK2A  CAMK2B  CAMK2D  CAMK2G  CAMK4  CAMKK1  CAMKK2  CASK  CHEK1  CHEK2  DAPK1  DAPK2  DAPK3  DCLK1  MAPKAPK2  MAPKAPK3  MARK1  MARK2  MARK3  MARK4  MELK  MKNK1  MKNK2  MYLK4  PASK  PHKG2  PIM1  PIM2  PLK1  PLK2  PLK3  PLK4  PRKAA1  PRKAA2  RPS6KA1_2  RPS6KA3_2  RPS6KA5_2  SNRK  STK11  STK17A  STK17B  STK40  TRIB1  TRIB2  TTN 
CK1_All CSNK1A1  CSNK1D  CSNK1E  CSNK1G1  CSNK1G2  CSNK1G3  TTBK1  TTBK2  VRK1  VRK2 
CMGC_All CDK1  CDK11B  CDK12  CDK13  CDK16  CDK2  CDK4  CDK5  CDK6  CDK7  CDK8  CDK9  CDKL1  CDKL2  CDKL3  CDKL5  CLK1  CLK2  CLK3  CLK4  CSNK2A1  CSNK2A2  DYRK1A  DYRK2  DYRK3  GSK3B  HIPK2  HIPK3  MAPK1  MAPK10  MAPK11  MAPK12  MAPK13  MAPK14  MAPK3  MAPK6  MAPK7  MAPK8  MAPK9  PRPF4B  SRPK1  SRPK2 
NEK_All NEK1  NEK2  NEK7 
STE_All MAP2K1  MAP2K2  MAP2K4  MAP2K6  MAP2K7  MAP3K14  MAP3K5  MAP3K8  MAP4K1  MAP4K3  MAP4K4  OXSR1  PAK1  PAK3  PAK4  PAK5  PAK6  SLK  STK10  STK24  STK25  STK26  STK3  STK4  STRADA  TAOK3  TNIK 
TKL_All ACVR1  ACVR2A  ACVR2B  ACVRL1  BMPR1B  BMPR2  BRAF  ILK  IRAK1  IRAK3  IRAK4  KSR1  KSR2  LIMK1  LIMK2  LRRK2  MAP3K12  MAP3K20  MAP3K21  MAP3K7  MAP3K9  RAF1  RIPK1  RIPK2  RIPK3  TGFBR1  TGFBR2  TNNI3K 
TYR_All ABL1  ABL2  ALK  AXL  BMX  BTK  CSF1R  CSK  DDR1  DDR2  EGFR  EPHA2  EPHA3  EPHA5  EPHA7  EPHA8  EPHB1  EPHB2  EPHB3  EPHB4  ERBB2  ERBB3  ERBB4  FES  FGFR1  FGFR2  FGFR3  FGFR4  FLT1  FLT3  FYN  HCK  IGF1R  INSR  ITK  JAK1_1  JAK1_2  JAK2_1  JAK2_2  JAK3_2  KDR  KIT  LCK  LMTK3  LYN  MERTK  MET  MST1R  NTRK1  NTRK2  NTRK3  PDGFRA  PTK2  PTK2B  PTK6  PTK7  RET  ROR1  ROR2  ROS1  RYK  SRC  SYK  TEK  TNK2  TYK2_1  TYK2_2  ZAP70 
OTHER_All AAK1  BMP2K  CDC7  CHUK  EIF2AK2  EIF2AK3  EIF2AK4_2  ERN1  GAK  IKBKB  MLKL  PBK  PKMYT1  RNASEL  STK16  TBK1  TLK2  TTK  ULK1  ULK2  ULK3  ULK4  WEE1  WEE2  WNK1  WNK3 
All.zip

Grouped by: Conformation label
Spatial Label Dihedral Label
DFGin_All BLAminus
BLAplus
ABAminus
BLBminus
BLBplus
BLBtrans
DFGin-Noise
DFGinter_All BABtrans
DFGinter-Noise
DFGout_All BBAminus
DFGout-Noise
Kinase group and gene
Group Gene
AGC_All AKT1  AKT2  CDC42BPB  DMPK  GRK2  GRK4  GRK5  GRK6  MASTL  PDPK1  PKN1  PKN2  PRKACA  PRKCA  PRKCB  PRKCH  PRKCI  PRKCQ  PRKG1  ROCK1  ROCK2  RPS6KA1_1  RPS6KA3_1  RPS6KA5_1  RPS6KA6_1  RPS6KB1  SGK1  STK32A  STK38 
CAMK_All AURKA  AURKB  AURKC  CAMK1  CAMK1D  CAMK1G  CAMK2A  CAMK2B  CAMK2D  CAMK2G  CAMK4  CAMKK1  CAMKK2  CASK  CHEK1  CHEK2  DAPK1  DAPK2  DAPK3  DCLK1  MAPKAPK2  MAPKAPK3  MARK1  MARK2  MARK3  MARK4  MELK  MKNK1  MKNK2  MYLK4  PASK  PHKG2  PIM1  PIM2  PLK1  PLK2  PLK3  PLK4  PRKAA1  PRKAA2  RPS6KA1_2  RPS6KA3_2  RPS6KA5_2  SNRK  STK11  STK17A  STK17B  STK40  TRIB1  TRIB2  TTN 
CK1_All CSNK1A1  CSNK1D  CSNK1E  CSNK1G1  CSNK1G2  CSNK1G3  TTBK1  TTBK2  VRK1  VRK2 
CMGC_All CDK1  CDK11B  CDK12  CDK13  CDK16  CDK2  CDK4  CDK5  CDK6  CDK7  CDK8  CDK9  CDKL1  CDKL2  CDKL3  CDKL5  CLK1  CLK2  CLK3  CLK4  CSNK2A1  CSNK2A2  DYRK1A  DYRK2  DYRK3  GSK3B  HIPK2  HIPK3  MAPK1  MAPK10  MAPK11  MAPK12  MAPK13  MAPK14  MAPK3  MAPK6  MAPK7  MAPK8  MAPK9  PRPF4B  SRPK1  SRPK2 
NEK_All NEK1  NEK2  NEK7 
STE_All MAP2K1  MAP2K2  MAP2K4  MAP2K6  MAP2K7  MAP3K14  MAP3K5  MAP3K8  MAP4K1  MAP4K3  MAP4K4  OXSR1  PAK1  PAK3  PAK4  PAK5  PAK6  SLK  STK10  STK24  STK25  STK26  STK3  STK4  STRADA  TAOK3  TNIK 
TKL_All ACVR1  ACVR2A  ACVR2B  ACVRL1  BMPR1B  BMPR2  BRAF  ILK  IRAK1  IRAK3  IRAK4  KSR1  KSR2  LIMK1  LIMK2  LRRK2  MAP3K12  MAP3K20  MAP3K21  MAP3K7  MAP3K9  RAF1  RIPK1  RIPK2  RIPK3  TGFBR1  TGFBR2  TNNI3K 
TYR_All ABL1  ABL2  ALK  AXL  BMX  BTK  CSF1R  CSK  DDR1  DDR2  EGFR  EPHA2  EPHA3  EPHA5  EPHA7  EPHA8  EPHB1  EPHB2  EPHB3  EPHB4  ERBB2  ERBB3  ERBB4  FES  FGFR1  FGFR2  FGFR3  FGFR4  FLT1  FLT3  FYN  HCK  IGF1R  INSR  ITK  JAK1_1  JAK1_2  JAK2_1  JAK2_2  JAK3_2  KDR  KIT  LCK  LMTK3  LYN  MERTK  MET  MST1R  NTRK1  NTRK2  NTRK3  PDGFRA  PTK2  PTK2B  PTK6  PTK7  RET  ROR1  ROR2  ROS1  RYK  SRC  SYK  TEK  TNK2  TYK2_1  TYK2_2  ZAP70 
OTHER_All AAK1  BMP2K  CDC7  CHUK  EIF2AK2  EIF2AK3  EIF2AK4_2  ERN1  GAK  IKBKB  MLKL  PBK  PKMYT1  RNASEL  STK16  TBK1  TLK2  TTK  ULK1  ULK2  ULK3  ULK4  WEE1  WEE2  WNK1  WNK3 
Download Pymol session for each:
Group Gene
AGC AKT1  AKT2  CDC42BPB  DMPK  GRK2  GRK4  GRK5  GRK6  MASTL  PDPK1  PKN1  PKN2  PRKACA  PRKCA  PRKCB  PRKCH  PRKCI  PRKCQ  PRKG1  ROCK1  ROCK2  RPS6KA1_1  RPS6KA3_1  RPS6KA5_1  RPS6KA6_1  RPS6KB1  SGK1  STK32A  STK38 
CAMK AURKA  AURKB  AURKC  CAMK1  CAMK1D  CAMK1G  CAMK2A  CAMK2B  CAMK2D  CAMK2G  CAMK4  CAMKK1  CAMKK2  CASK  CHEK1  CHEK2  DAPK1  DAPK2  DAPK3  DCLK1  MAPKAPK2  MAPKAPK3  MARK1  MARK2  MARK3  MARK4  MELK  MKNK1  MKNK2  MYLK4  PASK  PHKG2  PIM1  PIM2  PLK1  PLK2  PLK3  PLK4  PRKAA1  PRKAA2  RPS6KA1_2  RPS6KA3_2  RPS6KA5_2  SNRK  STK11  STK17A  STK17B  STK40  TRIB1  TRIB2  TTN 
CK1 CSNK1A1  CSNK1D  CSNK1E  CSNK1G1  CSNK1G2  CSNK1G3  TTBK1  TTBK2  VRK1  VRK2 
CMGC CDK1  CDK11B  CDK12  CDK13  CDK16  CDK2  CDK4  CDK5  CDK6  CDK7  CDK8  CDK9  CDKL1  CDKL2  CDKL3  CDKL5  CLK1  CLK2  CLK3  CLK4  CSNK2A1  CSNK2A2  DYRK1A  DYRK2  DYRK3  GSK3B  HIPK2  HIPK3  MAPK1  MAPK10  MAPK11  MAPK12  MAPK13  MAPK14  MAPK3  MAPK6  MAPK7  MAPK8  MAPK9  PRPF4B  SRPK1  SRPK2 
NEK NEK1  NEK2  NEK7 
STE MAP2K1  MAP2K2  MAP2K4  MAP2K6  MAP2K7  MAP3K14  MAP3K5  MAP3K8  MAP4K1  MAP4K3  MAP4K4  OXSR1  PAK1  PAK3  PAK4  PAK5  PAK6  SLK  STK10  STK24  STK25  STK26  STK3  STK4  STRADA  TAOK3  TNIK 
TKL ACVR1  ACVR2A  ACVR2B  ACVRL1  BMPR1B  BMPR2  BRAF  ILK  IRAK1  IRAK3  IRAK4  KSR1  KSR2  LIMK1  LIMK2  LRRK2  MAP3K12  MAP3K20  MAP3K21  MAP3K7  MAP3K9  RAF1  RIPK1  RIPK2  RIPK3  TGFBR1  TGFBR2  TNNI3K 
TYR ABL1  ABL2  ALK  AXL  BMX  BTK  CSF1R  CSK  DDR1  DDR2  EGFR  EPHA2  EPHA3  EPHA5  EPHA7  EPHA8  EPHB1  EPHB2  EPHB3  EPHB4  ERBB2  ERBB3  ERBB4  FES  FGFR1  FGFR2  FGFR3  FGFR4  FLT1  FLT3  FYN  HCK  IGF1R  INSR  ITK  JAK1_1  JAK1_2  JAK2_1  JAK2_2  JAK3_2  KDR  KIT  LCK  LMTK3  LYN  MERTK  MET  MST1R  NTRK1  NTRK2  NTRK3  PDGFRA  PTK2  PTK2B  PTK6  PTK7  RET  ROR1  ROR2  ROS1  RYK  SRC  SYK  TEK  TNK2  TYK2_1  TYK2_2  ZAP70 
OTHER AAK1  BMP2K  CDC7  CHUK  EIF2AK2  EIF2AK3  EIF2AK4_2  ERN1  GAK  IKBKB  MLKL  PBK  PKMYT1  RNASEL  STK16  TBK1  TLK2  TTK  ULK1  ULK2  ULK3  ULK4  WEE1  WEE2  WNK1  WNK3 
Identifier
0 00J  01I  01P  027  02A  02Z  032  03C  03K  03P  03Q  03X  03Z  041  044  046  048  04G  04K  04L  04Z  052  057  05B  05J  06F  06N  06Z  071  07J  07Q  07R  07S  07U  07Z  084  085  08G  08Z  094  09H  09J  09K  09V  09Z  0B0  0B9  0BG  0BQ  0BX  0BY  0BZ  0C0  0C3  0C4  0C5  0C6  0C7  0C8  0C9  0CE  0CI  0CK  0EI  0F0  0F2  0F4  0F5  0F9  0FK  0FN  0FO  0FR  0FS  0FY  0G1  0G2  0G3  0GW  0H2  0HD  0J3  0J8  0J9  0JA  0JE  0JF  0JG  0JH  0JJ  0JK  0JL  0K0  0K1  0K6  0KD  0KF  0LI  0NF  0NH  0NL  0NR  0NT  0NU  0NV  0O7  0O8  0O9  0OA  0OK  0OL  0OM  0ON  0OO  0OP  0OQ  0PF  0Q2  0R4  0RF  0RS  0RX  0S0  0S7  0S8  0S9  0SB  0SJ  0SO  0SQ  0SR  0SS  0ST  0SU  0SV  0SW  0SX  0SY  0T2  0TP  0UJ  0UN  0US  0UU  0UV  0UW  0V0  0VE  0VF  0VG  0VH  0VM  0VN  0WH  0WM  0WN  0WP  0X2  0X5  0X6  0XF  0XG  0XH  0XP  0XZ  0Y4  0YH  0YJ  0YO 
1 106  107  10K  10N  10Z  11G  11K  12C  12Z  13J  13L  13V  14I  15G  15T  15V  16K  16W  16X  17P  18E  18K  18R  18Z  199  19A  19B  19E  19K  19Q  19R  19S  19Z  1AM  1AO  1AU  1B4  1B5  1B6  1BJ  1BK  1BM  1BQ  1BR  1BU  1C7  1C8  1C9  1CD  1CK  1CX  1D1  1DR  1DT  1E0  1E8  1EH  1EL  1F8  1FM  1FN  1FV  1G0  1GK  1H4  1HK  1HW  1HX  1IF  1IJ  1IM  1IW  1IZ  1J2  1J3  1J4  1J5  1J6  1JC  1JI  1JX  1K2  1K3  1KA  1KO  1KP  1LB  1LC  1LE  1M3  1M8  1N1  1N3  1N6  1N8  1N9  1NP  1NX  1O5  1OA  1OB  1OC  1OO  1P5  1P6  1PF  1PH  1PP  1PU  1Q3  1Q4  1QG  1QJ  1QK  1QM  1QN  1QO  1R9  1RA  1RJ  1RO  1RQ  1RS  1RU  1SB  1SK  1ST  1SU  1SW  1V5  1VI  1WS  1WU  1WY  1XZ  1Y6  1YG  1YZ 
2 207  20K  20Z  215  21I  21O  21Z  222  22K  22L  22T  22Z  23D  242  24A  24K  24N  24R  24V  24Z  253  255  25J  25Q  25Z  26D  26K  26L  26Z  274  276  279  27D  27Z  287  292  29A  29B  29L  29X  29Y  29Z  2A2  2A6  2A8  2AI  2AN  2BZ  2C3  2C4  2CH  2D2  2GI  2HB  2HK  2HV  2HW  2HX  2I5  2I8  2IE  2IJ  2JZ  2K0  2K2  2K5  2K7  2KC  2KD  2M2  2NK  2NR  2NS  2OL  2OO  2OQ  2P5  2P7  2PU  2QK  2QT  2QU  2QV  2RL  2SB  2SC  2SH  2TA  2TR  2TT  2V1  2V2  2V3  2V9  2VL  2VT  2VU  2VV  2VW  2VX  2W6  2WC  2WE  2WF  2WG  2WI  2X6  2YE  2YK 
3 304  306  30E  30G  30K  30T  319  31S  31V  31W  31X  31Y  320  324  325  32W  330  337  33A  349  34I  34L  34O  34U  34W  34Y  351  353  358  35F  35H  35R  35W  35X  35Z  362  363  36H  36N  36O  36Q  36R  371  373  37J  37O  37Q  37W  386  38G  38M  38O  38P  38R  38W  38Z  390  396  39G  39I  39P  39Z  3A3  3AM  3B3  3BM  3C3  3C8  3C9  3D3  3D7  3D8  3D9  3DC  3DK  3DL  3DV  3DW  3DX  3E4  3E8  3EH  3EL  3EW  3EX  3EY  3FE  3FF  3FN  3FP  3FV  3FX  3G5  3GF  3GU  3H8  3HJ  3HK  3HN  3HQ  3HT  3I3  3I6  3I7  3IF  3IP  3IU  3J7  3JA  3JB  3JW  3JZ  3K3  3KC  3KZ  3L0  3LH  3NC  3ND  3NE  3NG  3NL  3NU  3NV  3NW  3O0  3O4  3O7  3O8  3OA  3OK  3OR  3OS  3OU  3OV  3P0  3P6  3Q0  3Q1  3Q2  3Q3  3Q4  3Q5  3Q6  3QS  3QT  3QW  3QX  3QY  3R0  3R1  3RA  3RC  3RF  3RH  3RJ  3RT  3RW  3S1  3SB  3SC  3SG  3SM  3T3  3T9  3TA  3TI  3U1  3U5  3U6  3U9  3UI  3UL  3UO  3UP  3UR  3V0  3WA  3WH  3WJ  3WK  3WN  3WO  3WR  3X7  3XK  3XL  3XM  3YO  3YR  3YT  3YV  3YX  3YY  3Z1  3Z2  3Z3  3Z4  3Z5  3Z6  3ZC 
4 400  404  406  40M  41B  422  42C  42I  42J  42K  42P  42Q  430  437  43A  446  44X  45B  45K  45Q  45R  460  464  466  467  469  46A  46C  46G  46K  477  47I  47W  47X  481  48B  48K  495  499  49B  49J  4AU  4B0  4B7  4BM  4C9  4CK  4CV  4CW  4DF  4DJ  4DK  4DL  4DN  4DO  4DQ  4DT  4E1  4E2  4E3  4EF  4EJ  4EK  4F2  4F6  4FT  4GD  4GF  4GU  4H5  4HK  4HW  4HZ  4IH  4J7  4JZ  4K0  4K4  4K7  4KA  4KH  4KK  4KT  4L5  4L6  4L7  4LH  4LO  4LY  4MG  4MH  4MK  4O7  4OK  4OQ  4OR  4P4  4PV  4QE  4QG  4QV  4QX  4QZ  4R0  4RB  4RJ  4RK  4RM  4RU  4RV  4S1  4S2  4S3  4SB  4SP  4ST  4T3  4T5  4T6  4T9  4TT  4TV  4TW  4UB  4UQ  4US  4UT  4V8  4V9  4VB  4VC  4VD  4VE  4VF  4VG  4VJ  4VQ  4VZ  4W1  4W5  4WD  4WE  4WG  4Y0  4YK  4YM  4YV  4YW  4YX  4Z5  4Z8  4ZB  4ZG  4ZH  4ZJ  4ZQ  4ZR